La organización fue fundada durante la década de 1970 por un grupo de miembros de la comunidad preocupados por los problemas de la comunidad y apoyados por la iglesia católica. Eventualmente en 1977, un grupo de señoras lideradas por la Sra. Tere Blanco, hoy considerada como la Fundadora de Juan Domingo en Acción, llega al barrio para ayudar a estas personas a desarrollarse como comunidad.

 

Bajo su liderazgo la organización fue incorporada como una organización sin fines de lucro, obtuvo las exenciones federales y estatales y comenzaron a recaudar fondos para desarrollar programas educativos estructurados. Su legado a la comunidad incluye la Biblioteca Comunitaria Tomás Blanco, un pre-escolar Montessori, y el rescate de la Escuela Juan Ponce de León.
Juan Domingo en Acción también está entrelazada con La Nueva Escuela Juan Ponce de León ya que esta nace en el corazón de la comunidad de Juan Domingo en la década de los 90.